制藥工程主要課程無機化學(xué)、有機化學(xué)、儀器分析、分析化學(xué)、生物化學(xué)、物理化學(xué)、化工原理、現(xiàn)代分子生物學(xué)、生物技術(shù)制藥、制藥工程原理與設(shè)備、藥物合成反應(yīng)、藥物化學(xué)、藥理學(xué)、藥劑學(xué)、天然藥物化學(xué)、應(yīng)用光譜解析、制藥工藝學(xué)、藥用高分子材料、制藥分離工程、藥物分析、制藥裝備與車間設(shè)計（制藥工程實訓(xùn)）、藥事管理學(xué)、藥品營銷等，部分中藥制藥學(xué)科還包括藥用植物學(xué)，中藥學(xué)，方劑學(xué)，中藥化學(xué)，中藥藥劑學(xué)，中藥炮制學(xué)，中藥制劑分析，中藥藥理學(xué)。制藥工程是一個化學(xué)、藥學(xué)（中藥學(xué)）和工程學(xué)交叉的工科類專業(yè)，以培養(yǎng)從事藥品制造，新工藝、新設(shè)備、新品種的開發(fā)、放大和設(shè)計人才為目標(biāo)。這個名稱正式出現(xiàn)在教育部的本科專業(yè)目錄是1998年。盡管制藥工程專業(yè)在名稱上是新的，但是從學(xué)科沿革來看它的產(chǎn)生并不是全新的，是相近專業(yè)的延續(xù)，也是中國科學(xué)技術(shù)發(fā)展到一定時期的產(chǎn)物。