（1）在承包人完成累計金額達到合同總價一定比例（雙方合同約定）后，采用等比率或等額扣款的方式分期抵扣。也可針對工程實際情況具體處理，如有些工程工期較短、造價較低，就無需分期扣還；有些工期較長，如跨年度工程，其預(yù)付款的占用時間很長，根據(jù)需要可以少扣或不扣。（2）從未完施工工程尚需的主要材料及構(gòu)件的價值相當(dāng)于工程預(yù)付款數(shù)額時起扣，從每次中間結(jié)算工程價款中，按材料及構(gòu)件比重抵扣工程預(yù)付款，至竣工之前全部扣清。其中，起扣點的計算公式如下：T=P-M/N式中T——起扣點，即工程預(yù)付備料款開始扣回時的累計已完成工程價值；M——工程預(yù)付款數(shù)額；N——主要材料及構(gòu)件所占比重；P——承包工程合同總額。不含保修金的計算：例如：某項工程合同價100萬，預(yù)付備料款數(shù)額為20萬，主要材料、構(gòu)件所占比重80%，問：起扣點為多少萬元？按起扣點計算公式：T=P－M/N=100-20/80%=75萬元則 當(dāng)工程量完成75萬元時，本項工程預(yù)付款開始起扣。含保修金的計算：如果承包合同中約定，工程質(zhì)量保修金從承包人每月的工程款中按比例扣留的話，工程預(yù)付款起扣點應(yīng)為T=P(1-K)-M/N，式中，T—起扣點，即預(yù)付款開始扣回的累計應(yīng)付工程款（累計完成工作量金額-相應(yīng)質(zhì)量保證金）；K—質(zhì)量保修金率；M—預(yù)付備料款數(shù)額；N—主要材料，構(gòu)件所占比重；P—承包工程價款總額（或建安工作量價值） 。