1976年，畢業(yè)于寧化一中，在福建省寧化縣插隊。1978年3月，廈門大學經(jīng)濟系計劃統(tǒng)計專業(yè)學習。1982年，加入中國共產(chǎn)黨。進入國家統(tǒng)計局，曾任統(tǒng)計局總經(jīng)濟師、新聞發(fā)言人、局長等職。1982年畢業(yè)，分配到國家統(tǒng)計局工作，先后任國家統(tǒng)計局國民經(jīng)濟綜合統(tǒng)計司副處長、處長、見習副司長、副司長、國家統(tǒng)計局總經(jīng)濟師、新聞發(fā)言人。1996-1997年，在美國斯坦福大學亞太研究中心作高級訪問學者；1997年任第八屆中華全國青年聯(lián)合會委員、常委。1998年，北京師范大學攻讀國際金融博士學位；1998年9月掛任安徽省省長助理。1999年9月，任國家統(tǒng)計局副局長、黨組成員。2003年7月，任國家統(tǒng)計局黨組副書記；2005年11月，任國家統(tǒng)計局黨組書記；2006年3月，任國家統(tǒng)計局局長；第十屆全國政協(xié)委員2006年10月，因在職期間收受不法企業(yè)主所送現(xiàn)金、生活腐化墮落、涉嫌重婚犯罪等，被雙開并移送司法機關，局長職務被免。2007年1月23日，中紀委監(jiān)察部嚴肅查處國家統(tǒng)計局原局長邱曉華嚴重違紀案件。獲罪入獄一年；2008年6月中旬出獄后，赴中國海洋石油總公司下屬研究機構任高級研究員。目前將任民生證券首席經(jīng)濟學家 。2008年8月28日，一篇題為《掌控當前經(jīng)濟形勢的政策建議》的文章出現(xiàn)在經(jīng)觀報網(wǎng)站上，該文針對當前中國宏觀經(jīng)濟面臨的復雜形勢，提出政策建議；文章末尾署名為“原國家統(tǒng)計局局長、現(xiàn)中海油高級研究員”。這是邱曉華2007年1月份被“雙開”消失后，首次以大型國企的高級研究員身份亮相媒體。2008年12月，邱曉華推出新著《中國經(jīng)濟新思考》，已出版并在購書網(wǎng)站上面市。2011年02月13日，開通新浪微博，只有2條微博，開通不到2天，已有2萬名粉絲。2012年8月，邱曉華新浪微博粉絲數(shù)已達5萬。 2014年10月，由澳門基金會與澳門城市大學經(jīng)濟研究所合作開展的科研項目《澳門“主權財富基金”研究》付梓完畢。由經(jīng)濟研究所所長邱曉華博士帶領下的課題組成員經(jīng)過多次深入澳門實地調研，并前往新加坡、阿聯(lián)酋、挪威、香港等地若干國際知名“主權財富基金”機構考察調研 。